Obraz pochodzi z początku XVI w. i nosi cechy przełomu gotyku i renesansu. Malowany jest techniką olejną na desce lipowej. Przedstawia Matkę Bożą z Dzieciątkiem Jezus na lewej ręce, w prawej w dwu palcach trzyma Ona kwiat koniczyny. Złote tło obrazu pokrywają wytłaczane ornamenty. Tradycja podaje, że obraz ofiarował do Kościoła św. Jana, książę Stanisław Radziwiłł, zwany Pobożnym.
W ciągu wieków zanotowano wiele łask i cudów. Pierwszy z nich mówi o uwolnieniu więźnia skazanego na śmierć w roku 1633, któremu po wezwaniu pomocy Najświętszej Panny kajdany same z rąk opadły i do dziś jako wotum wiszą w Kościele. To zapewne stało się przyczyną, że u Matki Bożej w Kościele św. Jana szukano ratunku, gdy kajdany niewoli krępowały naród lub poszczególnych ludzi. Modlił się tu także dnia 23 lutego 1684 r. król Jan III Sobieski, wracający spod Wiednia, dziękując Maryi za odniesione zwycięstwo. Tadeusz Kościuszko w dniu przysięgi na Rynku krakowskim - 24 marca 1794 r. przybył wieczorem do klasztoru i u stóp Matki Bożej prosił o pomoc w podjętej o wolność kraju walce.
Koronacji łaskami słynącego wizerunku Matki Bożej Świętojańskiej dokonał dnia 9 maja 1965 r. Metropolita krakowski Ks. Arcybiskup Karol Wojtyła. Uroczystość tę połączono z tradycyjną procesją ku czci św. Stanisława biskupa i męczennika z Wawelu na Skałkę i tam ukoronowano obraz w obecności biskupów Metropolii krakowskiej.
Niezbadane są drogi Opatrzności Bożej i przedziwna łaskawość Maryi. Ten, który tak głęboko przeżywał całą doktrynę św. Ludwika Grignon de Montfort - tajemnicę Maryi -został przez Nią wezwany, by rozpocząć swą arcypasterską posługę ludowi Metropolii krakowskiej od koronacji Jej wizerunku pod jednym bodaj w Polsce wezwaniem "Matki Bożej od Wykupu Niewolników". Maryja zechciała, aby Jej niewolnik, Jej sługa, noszący w herbie dewizę "Totus Tuus", pierwszej w swym życiu koronacji dokonał na wizerunku Tej, która przynosi wyzwolenie przez bezgraniczne, ufne oddanie się w Jej dłonie.
Modlitwa do Matki Bożej Fotografie Cudownego Obrazu Matki Bożej od Wykupu Niewolników Koronacja Obrazu Matki Bożej od Wykupu Niewolników Msze Święte i stałe Nabożeństwa w Sanktuarium Matki Wolności